国家一号文件《中共中央国务院关于加快发展现代农业 进一步增强农村发展活力的若干意见》强调，要促进工业化、信息化、城镇化、农业现代化同步发展，着力强化现代农业基础支撑，深入推进社会主义新农村建设。要大力培育现代流通方式和新型流通业态，发展农产品网上交易、连锁分销和农民网店。继续实施“北粮南运”、“南菜北运”、“西果东送”、万村千乡市场工程、新农村现代流通网络工程，启动农产品现代流通综合示范区创建。
一、当前农业电子商务发展中遇到的主要问题
近年来，电子商务产业发展迅猛，逐渐受到企业界和政府部门重视。作为我国立国之基的农业，要摆脱传统的束缚，创新发展农业电子商务是明智之举。而在当前农业电子商务的快速发展阶段，我们也看到了一些现实问题。
1、“信息孤岛”现象严重
一些涉农网站只和自己的上级网站“接头”，网站间缺乏信息交换机制，网站内容繁杂、雷同，农民难以从海量信息中查找真正有用的内容，各网站只是一个信息的传递平台，并未成为实质性的信息共享和交易平台。
2、受众局限
中国互联网络信息中心的数据显示，截至2010年底，我国农村互联网用户破亿，但仅占中国农村人口的15%.除了部分青年农民，大部分农民仍未养成上网的习惯，而即使是有上网习惯的农民，也更多地将上网视之为娱乐方式而非“致富之路”。
3、农业电子商务配套环节薄弱
商务部信息化司副司长聂林海曾表示：“我国目前农产品的生产和加工能力相对比较落后，农产品的质量标准体系也还没有完全建立，与国际农产品质量体系脱节。而且我国农产品电子商务网站的力量也比较薄弱，网站建设的高素质人才也不是很多。”此外，农产品的物流、配送机制不健全，涉农网站、平台主要集中在发达地区等也是制约农业电子商务发展的瓶颈。
针对这些情况，有关专家建议由政府引导，地方协调，搭建覆盖全国范围的电子商务试点平台，提高涉农网站的覆盖面。同时，建立农业信息的资源数据库，打破涉农网站各自为政的局面，整合、共享相关信息，还要打造国家地方结合的专业联盟物流公司体系，帮助农业电子商务解决后顾之忧。
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