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从表面上看，科学与宗教是两种不同的意识形态，是两种截然不同的观念。宗教强调的是对某种根本不存在的意识产物的崇拜，以幻想的形式来反应客观的世界;而科学强调对客观世界本质和规律的掌握，强调的是真理，他们之间是不存在任何沟通的必要。但从科学发展史上看，宗教究竟是一种阻碍还是一种促进，对此做出准确的回答却是相当的困难，因为任何一种简单的结论都经不起严格的考证。总的来说，科学与宗教在人类的发展史上既相互排斥，相互矛盾，又相互促进，互相包容，呈现错综复杂的关系。
一、科学和宗教关系的产生
对于宗教与科学的关系是学术界讨论和研究经久不衰的课题，并且形成了各种不同的观点和主张。总结起来主要有三种观点：一是“相互关联说”。持这种观点的人认为科学与宗教存在着密切的联系，科学与宗教相互渗透、相互作用并对各自的发展起着积极的推动作用。正如1940年9月爱因斯坦在美国“科学、哲学和宗教同民主生活方式的关系讨论会”上所作的题为《科学和宗教》的发言中指出：“科学没有宗教就像瘸子，宗教没有科学就像瞎子。”二是“冲突说。”持这种观点的人普遍认为科学与宗教是绝对对立的，是一对不可调和的矛盾，不是宗教摧残、压制科学，就是科学贬低推翻宗教观点。三是“分离说”、“互不干涉说”、“并行不悖说”等。持此种观点的人认为科学与宗教是分离的，各自代表了不同领域的知识，满足人类不同的社会需要，具有不同的社会职能，二者互不干涉。
毫无疑问上述观点都在一定的历史时期，都具有一定的合理性。然而，用一种观点，从一个侧面来论证宗教与科学的关系，显然不够全面、科学。要准确地理解科学与宗教的关系，首先必须了解科学和宗教的含义。什么是科学?科学是人类关于自然、社会和人的思维运动及其规律的知识体系。科学学的创始人、英国学者贝尔纳在《历史上的科学》一书中说：“科学可作为(1)一种建制;(2)一种方法;(3)一种积累知识传统;(4)一种维持或发展生产的主要因素;(5)构成我们的诸信仰和对宇和人类的诸态度的最强大势力之一。”“科学作为一种知识系统或理论系统，它一般由以下几个部分有机构成：(1)实验事实(这是整个知识系统的基础);(2)基本概念(由实验事实中抽象出概念，再从诸多概念中提炼或挑选出基本概念);(3)原理及定律(基本概念之间的关系，一般由归纳得出或假设提出，它们作为理论系统的逻辑基础);(4)逻辑推演系统(由逻辑概念出发，利用逻辑法则及数学方法进行推理);(5)一系列具体结论(逻辑演绎的结果，可与实验事实直接比较)。”
宗教的定义是：“总的来说，每个已知的文化中都包含了或多或少的宗教信仰。它们或明了或令人疑惑得试图完美解释这个世界。当某些行为典范在特定的一个文化中得到确立时，它就将在这个文化中打下深深的历史烙印。即便宗教在形式、完整度、可信度等等都应不同文化而不同，但人在社会中还是不可避免要受到宗教影响。”宗教是人类社会发展到一定历史阶段出现的一种文化现象，属于社会意识形态。在人类早期社会中，宗教承担了对世界的解释、司法审判、道德培养和心理安慰等功能。现代社会中，科学和司法已经从有些宗教分离出来，但是道德培养和心理安慰的功能还继续存在。
科学和宗教都是人类认识世界的体系。人类对世界的认识有两种方式:一是自然主义的;一是宗教的。无神论，人道主义，科学主义属于自然主义的方式;世界各大宗教属于宗教的进路。在人类社会发展的初期，生产力极其低下，为生存而积累的生存和生产的经验便成为早期的科学。但由于当时生产力的极度低下与大自然的强大的威力，许多的自然现象人类无法认识其本质，由此产生了对自然界的恐惧与崇拜。面对自己无法解释的种种诡异的自然现象，人类只好把此归结与神秘力量的存在，并通过对神灵的恭顺来求得神灵的庇护。正如“马林诺夫斯基认为，原始人把可以用经验科学和观察或传说加以处理的简单现象和他们所无法理解或控制的神秘不可估计的变化，明确区别开来。前者引向科学，后者导致巫术、神话和祭祀。因此科学，作为“人类的理论思维起源于对幻化的神话思维的超越”。人类在理性把握自然的过程中，形成了自己独特的思维方式——科学。因此，“巫术、占星术和宗教显然必须同科学的起源一并加以研究”。
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