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一、当前事业单位基建财务管理中存在的问题
(一)缺乏先进的基建财务管理理念
随着市场经济的不断发展，我国的事业单位也从过去的以非经营性项目为主的状态转变为进行多领域项目投资的经营性项目阶段，但是在这一过程中，许多项目建设的投资金额较小，人员配备也不够健全，建设的周期也较短，回报率也并不高，因此，并没有得到事业单位管理人员的足够重视，也因此缺少一个专项管理基建财务的办公部门，有些制度往往是纸上谈兵，执行力较差。
(二) 缺少专业素质过硬的基建财会人员
人是促进发展的关键，人的思维素质决定着工作效率的高低，当前，事业单位的基建财务管理中，一些财务人员素质较差，缺乏财务工作的相应经验，有的甚至并没有参与过基建财务的管理工作，也缺少财务管理专业的正规教育，专业知识含量不足，再加之对于基建财务管理工作的不熟悉，直接导致了许多问题的出现，往往是到了工程决算的阶段才认识到之前的核算分类与概算项目的划分不相符，可以说，这样专业素养不足的财务人员已经成为事业单位基建财务管理的重大隐患，个别人员由于价值观念歪曲甚至出于利己主义而占有公有资金，成为事业单位内部的毒瘤。
(三)基建财务核算不科学
我国对于事业单位的年终总决算把关较严，因此在年终决算时许多事业单位往往为了能够顺利的通过审核，在账务上进行了一定程度的调整，这种调整多数情况下是依据实际效益与计划投资的差额而采取的一种应变措施，一些企业缺少专门的基建财务管理部门，并没有一套真正意义上的基建财务核算管理体系，有的则直接沿用了企业建设项目过程中的核算办法，这直接导致了基建账目设置科目不健全，破坏了财务管理的完整性与真实性。
(四)缺乏对于预算的有效审查
首先，许多事业单位的基建项目并没有严格的依照所批准的可行性报告来规范的展开设计工作，个别的设计部门还出现了为了提高设计预算以达到多收取设计费的目的，这直接导致了预算在前期就已经严重失真和超标。其次是不负责的概算压缩，许多单位为了能够使项目申报成功，故意人为的压缩概算、预算，这样一来不仅较为容易通过审核，还能够减轻税务压力，但是一旦项目审批可以投入建设时，又会加大投资额度，甚至有的单位大搞计划外项目，在未经过审批的情况下盲目开展建设，导致了基建项目计划流于形式。最后是预算审核不够严格，这种现象的出现通常是由于管理上存在一定的问题，有的单位审而不调，对于一些项目的概算没有及时的做到有效的调整，导致的直接后果就是实际施工使用金额远远超出原计划的资金标准。
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